La Asamblea General es el órgano supremo de gobierno y de expresión de la voluntad de la Red Cántabra de Desarrollo Rural y está constituida por todos los socios de esta organización. La Asamblea General es soberana en todo lo relacionado con la RCDR y sus acuerdos son obligatorios para todos los socios, presentes o no en el momento de celebración de la misma.
La Asociación esta gestionada y representada por una Junta Directiva formada por Presidente, Vicepresidente, Secretario y Tesorero, de tal forma que exista un miembro por cada Grupo de Acción Local. Son miembros de la Junta Directiva los representantes de carácter institucional de los Grupos de Acción Local que tienen una duración de 4 años o cuando se termine el periodo legislativo de la Comunidad Autónoma.

Junta Directiva
- Presidente: Leoncio Carrascal – presidente del Grupo de Acción Local Asón-Agüera-Trasmiera
- Vicepresidente: Gregorio Alonso – presidente del Grupo de Acción Local Liébana
- Secretario: Secundino Caso – presidente del Grupo de Acción Local Saja Nansa
- Tesorero: Pedro Gómez – representante del Grupo de Acción Local Valles Pasiegos
- Vocal: Pablo Fernández – presidente del Grupo de Acción Local Campoo Los Valles